Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms