Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms