Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg2O55111 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms