Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syngr1O55100 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms