Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms