Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SlkO54988 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SlkO54988 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SlkO54988 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SlkO54988 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SlkO54988 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SlkO54988 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SlkO54988 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SlkO54988 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SlkO54988 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SlkO54988 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SlkO54988 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SlkO54988 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SlkO54988 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SlkO54988 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SlkO54988 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SlkO54988 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SlkO54988 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SlkO54988 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SlkO54988 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SlkO54988 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SlkO54988 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SlkO54988 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SlkO54988 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SlkO54988 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SlkO54988 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SlkO54988 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SlkO54988 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SlkO54988 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SlkO54988 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SlkO54988 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SlkO54988 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SlkO54988 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SlkO54988 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SlkO54988 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SlkO54988 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SlkO54988 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SlkO54988 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SlkO54988 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SlkO54988 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SlkO54988 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SlkO54988 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SlkO54988 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SlkO54988 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SlkO54988 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SlkO54988 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SlkO54988 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SlkO54988 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SlkO54988 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SlkO54988 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SlkO54988 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SlkO54988 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SlkO54988 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SlkO54988 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SlkO54988 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SlkO54988 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SlkO54988 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SlkO54988 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SlkO54988 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SlkO54988 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SlkO54988 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SlkO54988 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SlkO54988 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SlkO54988 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SlkO54988 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SlkO54988 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SlkO54988 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SlkO54988 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SlkO54988 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SlkO54988 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SlkO54988 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SlkO54988 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SlkO54988 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SlkO54988 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SlkO54988 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SlkO54988 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SlkO54988 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SlkO54988 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SlkO54988 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SlkO54988 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SlkO54988 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SlkO54988 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SlkO54988 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SlkO54988 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SlkO54988 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SlkO54988 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SlkO54988 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SlkO54988 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SlkO54988 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SlkO54988 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SlkO54988 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SlkO54988 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SlkO54988 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SlkO54988 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SlkO54988 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SlkO54988 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SlkO54988 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SlkO54988 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SlkO54988 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SlkO54988 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms