Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms