Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CrxO54751 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CrxO54751 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CrxO54751 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CrxO54751 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CrxO54751 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CrxO54751 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CrxO54751 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CrxO54751 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CrxO54751 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CrxO54751 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CrxO54751 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CrxO54751 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CrxO54751 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CrxO54751 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CrxO54751 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CrxO54751 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CrxO54751 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CrxO54751 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CrxO54751 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CrxO54751 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CrxO54751 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CrxO54751 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CrxO54751 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CrxO54751 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CrxO54751 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CrxO54751 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CrxO54751 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CrxO54751 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CrxO54751 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CrxO54751 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CrxO54751 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CrxO54751 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CrxO54751 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CrxO54751 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CrxO54751 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CrxO54751 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CrxO54751 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CrxO54751 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CrxO54751 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CrxO54751 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CrxO54751 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CrxO54751 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CrxO54751 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CrxO54751 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CrxO54751 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CrxO54751 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CrxO54751 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CrxO54751 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CrxO54751 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CrxO54751 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CrxO54751 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CrxO54751 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CrxO54751 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CrxO54751 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CrxO54751 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CrxO54751 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CrxO54751 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CrxO54751 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CrxO54751 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CrxO54751 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CrxO54751 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CrxO54751 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CrxO54751 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CrxO54751 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms