Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf9O35739 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf9O35739 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf9O35739 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf9O35739 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf9O35739 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf9O35739 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf9O35739 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf9O35739 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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