Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfibp2O35711 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms