Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-ObO35424 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms