Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxd2O35392 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms