Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Nedd9O35177 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Nedd9O35177 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Nedd9O35177 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Nedd9O35177 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Nedd9O35177 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Nedd9O35177 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Nedd9O35177 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nedd9O35177 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nedd9O35177 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Nedd9O35177 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd9O35177 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Nedd9O35177 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd9O35177 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd9O35177 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd9O35177 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd9O35177 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd9O35177 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd9O35177 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd9O35177 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd9O35177 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd9O35177 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd9O35177 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd9O35177 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd9O35177 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd9O35177 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd9O35177 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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