Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms