Protein–RNA interactions for Protein: O08790

Fpr-s1, Formyl peptide receptor-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fpr-s1O08790 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fpr-s1O08790 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fpr-s1O08790 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms