Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms