Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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