Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5294J3QP53 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms