Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21976J3QNN2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21976J3QNN2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21976J3QNN2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21976J3QNN2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21976J3QNN2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21976J3QNN2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21976J3QNN2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21976J3QNN2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21976J3QNN2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21976J3QNN2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21976J3QNN2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21976J3QNN2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21976J3QNN2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21976J3QNN2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21976J3QNN2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21976J3QNN2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm21976J3QNN2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm21976J3QNN2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms