Protein–RNA interactions for Protein: J3QNH3

Gm21788, Predicted gene, 21788, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21788J3QNH3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21788J3QNH3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21788J3QNH3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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