Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm17577J3QNF7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm17577J3QNF7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm17577J3QNF7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm17577J3QNF7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17577J3QNF7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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