Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm21972J3QN38 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm21972J3QN38 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm21972J3QN38 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm21972J3QN38 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm21972J3QN38 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm21972J3QN38 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm21972J3QN38 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm21972J3QN38 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm21972J3QN38 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm21972J3QN38 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm21972J3QN38 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm21972J3QN38 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm21972J3QN38 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21972J3QN38 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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