Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm20918J3QN17 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm20918J3QN17 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm20918J3QN17 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm20918J3QN17 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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