Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.33■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms