Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm29394H3BIW7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms