Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4bG5E8Z2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4bG5E8Z2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms