Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms