Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nccrp1G3X9C2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms