Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SprtnG3X912 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SprtnG3X912 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms