Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Colca2F8VPY8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Colca2F8VPY8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Colca2F8VPY8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Colca2F8VPY8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Colca2F8VPY8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Colca2F8VPY8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colca2F8VPY8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colca2F8VPY8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colca2F8VPY8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colca2F8VPY8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colca2F8VPY8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colca2F8VPY8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colca2F8VPY8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colca2F8VPY8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colca2F8VPY8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colca2F8VPY8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colca2F8VPY8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Colca2F8VPY8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Colca2F8VPY8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colca2F8VPY8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colca2F8VPY8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Colca2F8VPY8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Colca2F8VPY8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Colca2F8VPY8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Colca2F8VPY8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Colca2F8VPY8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Colca2F8VPY8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms