Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-M1F7CXU4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms