Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms