Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm8444F6XS56 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms