Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933403O08RikF6UK53 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms