Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syngap1F6SEU4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngap1F6SEU4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syngap1F6SEU4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms