Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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BC067074F6RXI4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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BC067074F6RXI4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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BC067074F6RXI4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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BC067074F6RXI4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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BC067074F6RXI4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BC067074F6RXI4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BC067074F6RXI4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BC067074F6RXI4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BC067074F6RXI4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BC067074F6RXI4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
BC067074F6RXI4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
BC067074F6RXI4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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BC067074F6RXI4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BC067074F6RXI4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BC067074F6RXI4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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BC067074F6RXI4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC067074F6RXI4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC067074F6RXI4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC067074F6RXI4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC067074F6RXI4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC067074F6RXI4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC067074F6RXI4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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BC067074F6RXI4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC067074F6RXI4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC067074F6RXI4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC067074F6RXI4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC067074F6RXI4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC067074F6RXI4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC067074F6RXI4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC067074F6RXI4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC067074F6RXI4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC067074F6RXI4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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BC067074F6RXI4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC067074F6RXI4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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BC067074F6RXI4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC067074F6RXI4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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BC067074F6RXI4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
BC067074F6RXI4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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