Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms