Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrdnE9Q9K5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TrdnE9Q9K5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms