Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms