Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K2

Gm17728, Predicted gene, 17728, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17728E9Q5K2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17728E9Q5K2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17728E9Q5K2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms