Protein–RNA interactions for Protein: E9Q411

Nbas, Neuroblastoma-amplified sequence, mousemouse

Predictions only

Length 2,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbasE9Q411 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NbasE9Q411 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NbasE9Q411 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NbasE9Q411 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NbasE9Q411 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NbasE9Q411 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NbasE9Q411 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NbasE9Q411 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NbasE9Q411 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NbasE9Q411 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NbasE9Q411 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NbasE9Q411 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms