Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L2

Pi4ka, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4kaE9Q3L2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pi4kaE9Q3L2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4kaE9Q3L2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms