Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r238E9Q373 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r238E9Q373 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms