Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tarbp1E9Q368 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms