Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc171E9Q1U1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
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