Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Zfp558E9Q1J0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Zfp558E9Q1J0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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