Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r68E9Q0V3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms