Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
2610021A01RikE9Q0Q3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms