Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930426L09RikE9Q0N7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms