Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdr1E9Q0B4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdr1E9Q0B4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms